Certaines de ces liaisons nécessiteraient un rebroussement....

De toutes façons bien peu de voies de l'étoile ferroviaire permettraient un trafic nouveau assez fréquent... seule la ligne Strasbourg-Lauterbourg (desservant Bischheim, Hoenheim-Tram...) a de la place en réserve, mais comme la gare est déjà très chargée (il faut bien y passer si on veut desservir du monde)...
Il faudrait donc de nouveaux aménagements (shunts, voies nouvelles - qui pourraient être faites sous forme "tram-train" comme la Tangentielle Nord...) afin de ne pas plomber le gros du trafic.

Une vidéo montrant l'axe d'urbanisation "Deux Rives" et le tracé de la ligne D vers Kehl (que j'ai également posté sur le sujet concernant l'extension de la ligne D vers Kehl) évoque la halte TER au Port du Rhin. Le projet est donc toujours d'actualité ?

Oui mais pas aux mêmes horizons.

Ils disaient que cela viendra après le tram, quand le secteur sera véritablement urbanisé.

Ils ont de l'argent à la CUS pour faire une vidéo d'information avec des représentations en images de synthèse !

La région Alsace m'a répondu à un mail, envoyé il y a quelques semaines.

De leurs côtés, aucune nouvelle halte prévue, même Port du Rhin.
Et j'avais demandé à tout hasard si des études avaient été faites pour une halte à l'E3, réponse positive mais elle ne verra pas le jour car le BHNS serait plus adapté (ce qui n'est pas faux évidemment, mais je pense que ça n'était pas incompatible, plutôt complémentaire).

La gare du Port du Rhin est-elle encore utilisée ?

La gare de marchandises ? Oui, elle est extrêmement utilisé par le Port autonome pour la desserte de ses emprises.

https://maps.google.fr/maps?q=gare+de+s ... 25,,0,1.64

On parle bien de cette gare ?

Étant donné qu'il n'y a pas d'autres gares dans les environs, oui (sauf Kehl).

Il s'agit d'une gare uniquement marchandises, il n'y a pas d'activité voyageurs (pas de quais).